Вот я щёлкаю по нужной папке правой мышой, выбираю в контекстном меню: Diagrams --> Show Diagram... --> Java Class Diagrams и появляется картинка, где представлены все классы. Перетаскиваю их с места на место, расставляя так как надо, сохраняю файл... И вот тут проблема: В сохранённом файле классы изображены вовсе не на тех местах, где были в момент сохранения. Как исправить это?