Подскажите как можно сократить ввод данных, я так понимаю через массив?

Можно не создавать каждый раз переменную для сохранения строки, а сохранять только число:

BufferedReader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));
int m = Integer.parseInt(reader.readLine());
int n = Integer.parseInt(reader.readLine());

Массивы нужны для упорядоченного хранения данных одного типа, это немного другое. В этой задаче у тебя есть конкретно две стороны, с изменением требований их не станет ни три, ни пять, ни десять. А если в задаче просто требуется ввести n чисел с клавиатуры, то ты конечно будешь хранить их в массиве.

BufferedReader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));
int n = 10;  // устанавливаем размер массива
int[] array = new int[n]; // создаем новый массив целых чисел размера n

for (int i = 0; i < array.length; i++){ // повторяя n раз
    array[i] = Integer.parseInt(reader.readLine()); // считываем с клавиатуры число и кладем в i-тый элемент массива
}